У нас есть плагин, например antiflood.amxx и мы хотим его установить себе на сервер

1) Копируем файл antiflood.amxx в папку

\addons\amxmodx\plugins\
2) Открываем файл plugins.ini, находится он тут

\addons\amxmodx\configs\

и в конец файла вписываем antiflood.amxx , сохраняем и закрываем файл.
3) Перезапускаем сервер или меняем карту на сервере (Если он запущен)
На этом установка закончена.
Или можно посмотреть Здесь